El Consejo de Comunidades se encarga de dar seguimiento continuo a las comunidades que se forman luego del Retiro Kerigmático, desde su etapa transitoria hasta que pasan a comunidades permanentes, para que perseveren en Espíritu y Verdad. Dentro de la estructura del Consejo, las comunidades están agrupadas por claustros, cada claustro está formado por 6 comunidades. El Consejo de Comunidades está formado por un Coordinador y los Enlaces según las categorías de comunidades: Adultos Mixtos, Matrimonios, Jóvenes y Novios.